|
ПРОСТРАНСТВЕННАЯ
СТРУКТУРА КАНОНИЧЕСКОГО НАБОРА АМИНОКИСЛОТ Персональная страница №2 |
Книга В.А.Карасева и В.В.
Лучинина "Введение в конструирование
бионических наносистем" Сайты В.А.Карасева: Принципы
топологического кодирования белков New Молекулярная векторная
машина белков http://vector-machine.narod.ru В помощь атеисту: Новая теория,
объясняющая сущность и происхождение жизни |
Добро пожаловать! Благодарю за посещение моей странички. Белки состоят из 20
вариантов аминокислот, которые называются
каноническими. Именно эти аминокислоты кодируются триплетами
генетического кода (http://genetic-code.narod.ru). Вопрос о том, почему
именно канонические аминокислоты присутствуют в белках и почему их именно
20 до сих пор не имеет в науке точного
ответа. Существуют разнообразные подходы как к классификации канонического
набора аминокислот, так и к построению их пространственной структуры [1-11], но они на
поставленные вопросы полностью не отвечают. На нескольких
ВЕБ-страничках, шаг за шагом, мы попробуем ответить на эти вопросы с позиции
разрабатываемой нами теории топологического кодирования белков (http://genetic-code.narod.ru). Необходимость изложения на нескольких страничках связана с
тем, что обсуждаемые вопросы не так просты, как кажутся на первый взгляд, и
имеют несколько уровней сложности. На этой страничке мы представим
пространственную структуру канонического набора аминокислот [12-16] без
объяснения природы этой структуры. Принципы построения пространственной структуры канонического
набора аминокислот: 1.
Основа для построения – структура додекаэдра. 2.
Принцип антисимметрии
боковых цепей аминокислот по отношению друг к другу при расположении
на додекаэдре . 3.
Расположение боковых цепей на додекаэдре - в порядке
возрастания молекулярной массы. Другая страничка, которую
мы планируем открыть, будет связана с моделью молекулярной векторной машиной
белков (http://vector-machine.narod.ru). Вот на ней-то Вы и узнаете, почему удалось построить структуру
аминокислот на додекаэдре с использованием принципа антисимметрии.
Планируются и другие странички, но о них пока говорить не будем. Наша страничка
ориентирована на посетителей любого уровня, поэтому те, кто уже «всё знают»,
могут пропускать элементарные вещи, которые могут быть интересны
неподготовленным читателям. Адрес для связи: amino-acids-20@yandex.ru. |
|
|
|
4. Антисимметрии в системе канонических аминокислот
5.
Вариант
построения системы канонических аминокислот без додекаэдра
|
Итак, Вы
познакомились с разработанной нами моделью структуры канонического набора
боковых цепей аминокислот. Основная модель построена на додекаэдре, но возможно
ее построение и без додекаэдра. Принципиально они сходны. Однако возникает
проблема выбора: какой же вариант предпочтительнее? Для нас это вопрос
решенный: предпочтительнее все же додекаэдр. Однако, для того, чтобы осознанно
сделать этот выбор, необходимо ознакомится с другой нашей страничкой,
посвященной модели молекулярной векторной машины белков: http://vector-machine.narod.ru.
Желаем Вам дальнейших научных впечатлений!
Адрес для связи: amino-acids-20@yandex.ru
RРабота выполнялась в
Центре микротехнологий и диагностики (ЦМИД) Санкт-Петербургского
государственного электротехнического университета "ЛЭТИ", при
финансовой поддержке университета
Благодарность:
Выражаю искреннюю благодарность
Беляеву А.И. за помощь в редактировании английской версии этой странички.