4.2.1. Квази-зеркальная антисимметрия                                      

 

Антисимметричные аминокислоты, располагающиеся по обе стороны от плоскости I, которую мы назвали плоскостью квази-зеркальной антисимметрии образуют пары, обладающие близкими физическими свойствами, но разной длиной цепи или массой. Справа от плоскости I оказались более короткие или более легкие боковые цепи (они показаны на светло-зеленом фоне), а слева – более длинные или тяжелые (темно-зеленый фон). Чтобы это видеть более детально, боковые цепи представлены вне додекаэдра.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Наш анализ будем проводить сверху вниз. В самом верху справа и слева распологаются боковые цепи серина (Ser - справа) и треонина (Thr - слева), обе имеют С-ОН-группу, но треонин имеет еще и метильную группу.

 

Чуть ближе к центру располагаются цистеин (Cys - слева) и метионин (Met - справа). Цистеин более легкая серусодержащая боковая цепь, метионин – более тяжелая, у которой метильная группа, связанная с атомом серы, препятствует проявлению слабокислых свойств, характерных для цистеина.

 

В вершинах додекаэдра, связанных ребром с серином и треонином, ниже располагаются аспарагиновая (Asp - справа) и глютаминовая (Glu - слева) кислоты. Их боковые цепи содержат на конце группы О=С-ОН, обладающие кислотными свойствами. Глютаминовая кислота на одну СН2-группу длиннее аспарагиновой кислоты.

 

Еще ниже, ближе к центру, располагается пара неполярных боковых цепей – валина (Val – справа) и изолейцина (Ile – слева). Последний на одну метильную группу длиннее валина.

 

В вершинах, связанных ребрами с цистеином и метионином, располагаются аспарагин (Asn – справа)  и глютамин (Gln – слева). Это нейтральные боковые цепи, способные к образованию водородных связей. Имеют одинаковую группу O=C-NH2, но цепь глютамина длиннее на одну СН2-группу.

 

Вершины, занимаемые аспарагиновой и глютаминовой кислотами, связаны с вершинами, в которых расположены боковые цепи аргинина (Arg – справа) и лизина (Lys – слева). Обе аминокислоты проявляют щелочные свойства.  У лизина – более длинная боковая цепь .

 

С вершинами аргинина и лизина связаны ребрами  вершины, в которых располагаются боковые цепи гистидина (His – справа) и триптофана (Trp – слева). Каждая из них содержит пятичленный цикл.  У триптофана к нему присоединен четырехзвенный фрагмент, образующий с пятичленным циклом дополнительный шестичленный цикл.  Обладают слабощелочными свойствами.

 

Ближе к центру внизу располагается пара циклических боковых цепей, имеющих шестичленные циклы - фенилаланин (Phe –справа) и тирозин (Tyr – слева). При этом тирозин на атом кислорода длиннее, чем фенилаланин. Обладают слабокислыми свойствами.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Таким образом, мы убедились, что распределение пар боковых цепей относительно плоскости I находится в точном соответствии с заданным принципом квази-зеркальной антисимметрии: справа располагаются более легкие боковые цепи, слева - более тяжелые, а их физические свойства в парах близки.

 

Для дальнейшего знакомства с антисимметриями аминокислот, которые выявляются с помощью нашей модели, перейдите в разделы 4.2.2., 4.2.3 , 4.2.4. или вернитесь в раздел 4.

 

 На главную страницу

 Адрес для связи: amino-acids-20@yandex.ru

 

Сайт управляется системой uCoz