4.2.3. Поворотная антисимметрия
Этот тип антисимметрии возникает для двух групп боковых цепей,
располагающихся над и под плоскостью III, разделяющей додекаэдр на две части:
верхнюю и нижнюю. Если верхнюю часть додекаэдра, в которой боковые цепи
аминокислот изображены в кружках розового цвета, вращать вокруг оси,
расположенной в плоскости III,
то вершины верхней части совпадут с вершинами нижней части додекаэдра, в
которых боковые цепи аминокислот помещены в кружки голубого цвета.
Образующиеся пары боковых цепей связаны между собой преобразованием вращения,
которое мы обозначили буквой гамма (g). Они имеют противоположные свойства
и разный размер |
||||||
|
|
|
В отличие от предыдущих типов антисимметрии,
которые имеют отношение к 8 парам боковых цепей, этот тип антисимметрии
включает все 10 пар аминокислот. Две пары аминокислот расположены в плоскости
I. Первая
пара образована глицином (Gly),
у которой нет боковой цепи - находится над плоскостью III (далее
будем говорить – над плоскостью), и
пролином (Pro - находится под
плоскостью III), образующим пятичленный
цикл, встроенный в основную цепь белка. Она показана в первом столбце с
правой стороны. Свойства
их противоположны: глицин не имеет боковой цепи и не влияет на рост
альфа-спирали, тогда как пролин,
образующий пятичленный цикл, встроенный в основную цепь белка,
прерывает ее развитие. Справа
располагаются пары боковых цепей аланина (Ala -
над плоскостью) и лейцина (Leu -
под плоскостью) III.
Они показаны в третьем столбце с левой стороны. Их свойства также
противоположны: аланин имеет самую короткую неполярную боковую цепь, а лейцин
– самую длинную. Ниже
с правой строны додекаэдра располагается пара серин (Ser - над плоскостью) – гистидин (His -
под плоскостью), а с левой строны – треонин (Thr -
над плоскостью) – триптофан (Trp - под плоскостью). Их
свойствах в парах противоположны: вверху располагаются легкие боковые цепи
с группой С-ОН, а внизу – тяжелые
боковые цепи с пятичленными циклами. Боковая
цепь цистеина (Cys – над плоскостью) образует пару с фенилаланином (Phe -
под плоскостью) с правой стороны, а боковая цепь метионина (Met –
над плоскостью) с тирозином (Tyr – под плоскостью) – с левой стороны додекаэдра. Свойства их
также противоположны: серосодержащие боковые цепи противостоят боковым цепям
с шестичленными циклами. Боковая
цепь аспарагиновой кислоты (Asp – над плоскостью) образует пару с аргинином (Arg –
под плоскостью) – с правой стороны додекаэдра. Боковые цепи в этой паре
обладают противоположными свойствами: аспарагиновая кислота является
протонодонором и может быть заряжена отрицательно, а аргинин –
протоноакцептором и может быть заряжен положительно. Аналогичные
свойства проявляются в паре глютаминовая кислота (Glu –
над плоскостью) и лизин (Lys – под плоскостью), расположенной в левой части додекаэдра. Последняя
пара боковых цепей с правой стороны образована нейтральным аспаргином (\Asn –
над плоскостью), способным к образованию Н-связей, и валином (Val –
под плоскостью), неполярной боковой цепью, не образующей Н-связей. Очевидно, что их свойства также
противоположны. С левой стороны додекаэдра аналогичная пара - глютамин (Gln –
над плоскостью) – изолейцин (Ile – под плоскостью). |
|
|
|
Итак, мы убедились,
что аминокислоты, связанные поворотной антисимметрией, обладают в парах противоположными
свойствами. |
Для дальнейшего
знакомства с антисимметриями аминокислот, которые выявляются с помощью нашей
модели, перейдите в разделы 4.2.1., 4.2.2., 4.2.4. или вернитесь в раздел
4.
Адрес для связи: amino-acids-20@yandex.ru