4.2.3. Поворотная антисимметрия

 

Этот тип антисимметрии возникает для двух групп боковых цепей, располагающихся над и под плоскостью III, разделяющей додекаэдр на две части: верхнюю и нижнюю. Если верхнюю часть додекаэдра, в которой боковые цепи аминокислот изображены в кружках розового цвета, вращать вокруг оси, расположенной в плоскости III, то вершины верхней части совпадут с вершинами нижней части додекаэдра, в которых боковые цепи аминокислот помещены в кружки голубого цвета. Образующиеся пары боковых цепей связаны между собой преобразованием вращения, которое мы обозначили буквой гамма (g). Они имеют противоположные свойства и разный размер

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 В отличие от предыдущих типов антисимметрии, которые имеют отношение к 8 парам боковых цепей, этот тип антисимметрии включает все 10 пар аминокислот. Две пары аминокислот расположены в плоскости I.

 

Первая пара образована глицином (Gly), у которой нет боковой цепи - находится над плоскостью III (далее будем говорить – над плоскостью),  и пролином (Pro - находится под плоскостью III), образующим пятичленный цикл, встроенный в основную цепь белка. Она показана в первом столбце с правой стороны.

 

Свойства их противоположны: глицин не имеет боковой цепи и не влияет на рост альфа-спирали, тогда как пролин,  образующий пятичленный цикл, встроенный в основную цепь белка, прерывает ее развитие.

 

Справа располагаются пары боковых цепей аланина (Ala - над плоскостью) и лейцина (Leu - под плоскостью) III. Они показаны в третьем столбце с левой стороны. Их свойства также противоположны: аланин имеет самую короткую неполярную боковую цепь, а лейцин – самую длинную.

 

Ниже с правой строны додекаэдра располагается пара серин (Ser - над плоскостью) – гистидин (His - под плоскостью), а с левой строны – треонин (Thr - над плоскостью) – триптофан (Trp - под плоскостью).   Их свойствах в парах противоположны: вверху располагаются легкие боковые цепи с  группой С-ОН, а внизу – тяжелые боковые цепи с пятичленными циклами.

 

Боковая цепь цистеина (Cys – над плоскостью) образует пару с фенилаланином (Phe - под плоскостью) с правой стороны, а боковая цепь метионина (Met – над плоскостью) с тирозином (Tyr – под плоскостью) – с левой стороны додекаэдра. Свойства их также противоположны: серосодержащие боковые цепи противостоят боковым цепям с шестичленными циклами.

Боковая цепь аспарагиновой кислоты (Asp – над плоскостью) образует пару с аргинином (Arg – под плоскостью) – с правой стороны додекаэдра. Боковые цепи в этой паре обладают противоположными свойствами: аспарагиновая кислота является протонодонором и может быть заряжена отрицательно, а аргинин – протоноакцептором и может быть заряжен положительно.

 

Аналогичные свойства проявляются в паре глютаминовая кислота (Glu – над плоскостью) и лизин (Lys – под плоскостью), расположенной в левой части додекаэдра.

 

Последняя пара боковых цепей с правой стороны образована нейтральным аспаргином (\Asn – над плоскостью), способным к образованию Н-связей, и валином (Val – под плоскостью), неполярной боковой цепью, не образующей Н-связей.  Очевидно, что их свойства также противоположны. С левой стороны додекаэдра аналогичная пара  - глютамин (Gln – над плоскостью) – изолейцин (Ile – под плоскостью).

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Итак, мы убедились, что аминокислоты, связанные поворотной антисимметрией,  обладают в парах противоположными свойствами.

 

Для дальнейшего знакомства с антисимметриями аминокислот, которые выявляются с помощью нашей модели, перейдите в разделы 4.2.1., 4.2.2., 4.2.4. или вернитесь в раздел 4.

 

На главную страницу

 Адрес для связи: amino-acids-20@yandex.ru 

Сайт управляется системой uCoz